宁夏医科大学总医院的前身是南京国民政府时期建立的宁夏省立医院，始建于1935年秋。当时并无专业的工作人员和设备，实际为宁夏卫生实验处（卫生厅前身）人员兼办。至1940年省立医院医院才从卫生实验处分出后独立经营，时设内外妇科，简易病床15张，工作人员20多人，有显微镜、30毫安X光机和部分简单设备，日门诊20－30人次，仅能医治小伤小病，最大的手术只能做阑尾切除。1949年9月宁夏解放后，由人民政府接营，经过党和政府的整顿与改造，医院规模得到扩充，病床达到40张，日门诊达到100人次以上。历经半个多世纪，伴随着改革开放的深入，尤其十一届三中全会以来，医院领导坚持正确的办院方向，以邓小平理论和“三个代表”的重要思想为指导，以病人为中心，开展方便、快捷、优质、高效的医疗服务，使医院得到迅速发展。目前，医院已成为全区设施齐全、科教领先、医疗一流的现代化综合性三级甲等医院。
 
民国23年(1934年)12月，南京国民政瘵卫生署派员来宁筹建宁夏卫生实验处（自治区卫生厅前身），地址在原宁夏县长统领余鼎铭公（利群东街、原银川一中东侧)
1935年秋，由卫生实验处负责组建宁夏省立医院
1940年，宁夏省立医院从卫生实验处分出独立经营
1949年9月宁夏解放，宁夏省立医院由解放军十九兵团派出的卫生组接管，并改称为宁夏省人民医院
1951年，国家拨款销并入甘肃，省人民医院入为甘肃省第二人民医院
1958年10月，宁夏回族自治区成立，医院改称为宁夏回族自治人民医院
1962年又改称为宁夏回族自治区第一人民医院
1969年再次改称为宁夏回族自治区人民医院
1970年6月，增挂宁夏医学院附属医院牌子，当时为一个机构两块牌子
1973年，正式改称为宁夏医学院附属医院
1979年，宁夏医学院附属医院成立护士学校，至1983年撤销
1995年12月被卫生部评审为自治区首家三级甲等医院
2004年12月18日，增挂牌宁夏医学院临床学院
2008年9月，宁夏医学院更名为宁夏医科大学，医院随之更名为宁夏医科大学附属医院。
2010年12月，经自治区编办批准，医院更名为宁夏医科大学总医院